Das LWL-Museumsamt konzipiert regelmäßig Sonderausstellungen, teilweise in Kooperation mit anderen Institutionen. Diese stellt es den Museen in Westfalen-Lippe zur Verfügung, so dass sie nacheinander an verschiedenen Orten zu sehen sind. Organisation, Produktion und Logistik liegen in den Händen des hauseigenen Teams, ebenso wie ausstellungsbegleitende Publikationen. Zu vielen Ausstellungen stehen museumspädagogische Begleitprogramme zur Verfügung. Präsentiert werden natur- und kulturhistorische Themen mit Westfalenbezug.